中波红外器件从单色、双色，向多光谱方向发展，金属微纳结构是实现中波红外光谱功能的核心器件，为研究中红外透射光谱特性并实现透射光谱的调制，基于表面等离激元共振(SPs)理论，结合有限时域差分法(FDTD)对薄膜型金属微纳孔阵列的透射光谱进行了模拟研究。深入分析了入射光源在中红外3.0～5.0μm波段内，孔洞的形状和大小、孔阵列周期、金属膜层厚度以及金属材质对光谱透射特性的影响。通过设计模拟不同结构，发现透射光谱强度主要由孔洞结构的大小决定，改变阵列的周期可以调制透射峰位，同时透射强度随着金属膜厚度的减小而快速增大，金属材质Ag更易于中红外光的透射；进一步依据圆孔半径(方孔边长)、阵列周期以及透射峰位，用最小二乘法拟合得到了不同结构模型对应的设计关系式，即在理论层面实现了3.0～5.0μm波段金属微纳结构透射光谱的调制功能，为多通道孔阵滤波器以及光谱探测设备的设计提供了理论依据。